Re: studi di docking

From: Bruno Rizzuti <antispam_at_anti.spam>
Date: Thu, 05 Feb 2009 16:56:16 +0100

** ha scritto:

> ok...quindi affermare che una molecola, con una certa sostituzione
> anzich� un'altra, incrementa le interazioni con un'altra molecola, e che
> questo � stato confermato da studi di docking, significa che � stato
> calcolato...non esiste un motivo ben preciso...giusto?

> non so se mi sono spiegata bene...


No, sei un po' vaga. Ma, d'altra parte, anche una frase del tipo
"incrementa le interazioni con un'altra molecola" e' a dir poco vaga, se
non si aggiunge altro.

In tutti i casi, i calcoli di docking (come sottolineava Giorgio Pastore)
avvengono sulla base di un campo di forza che -seppur dipendendo dal
livello di descrizione utilizzata- modellizza la realta' fisica delle
interazioni atomiche nel sistema considerato. Quindi non e' vero che "non
esiste un motivo ben preciso". Al contrario, il motivo esiste ed e'
preciso: l'insieme delle interazioni presenti nel sistema concorre a
determinare quanto viene affermato (almeno dal punto di vista simulativo,
ossia teorico).

Ciao, Bruno.




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Received on Thu Feb 05 2009 - 16:56:16 CET

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